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Somers et al. (2004)でマップされたSSRマーカーに関しての調査結果を公表します。
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(1)調査対象系統
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系統番号順(本プロジェクトでの系統番号順に表示します)
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系統分類別(系統の分類別に表示します)
(2)プライマー情報
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NBRP・コムギでデータを収集し、合成した全マーカーのリストを公表します。ファイルのダウンロード(xlsファイル)。
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リストは暫定的なもので、今後アニーリング温度、マーカーとしての有用性(シングルバンドなど)を載せていく予定です。
参考までに、
(3)PCR条件
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NBRP・コムギ DNAマーカーの多型調査プロジェクトでは、DMSOとベタインを含む反応液でPCRすることで安定したSSRの増幅を図っています。※反応液の組成
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全てのSSRマーカーに対し、同じ反応液を用いています。
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非特異的増幅を抑えるため、原著と同じか高めのアニーリング温度でPCRを行っています。※PCRの反応条件
PCR条件のダウンロード(docファイル)
(4)マーカー情報の公開(暫定版)
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WEBによるインタラクティブなマーカー情報公開に先立ち国内の研究者にマーカー情報を公開します。
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公開するデータは、擬似的電気泳動パターンとバンドサイズに関するCSVファイルです。バンドサイズについては解析ソフトウエアによる推定値を示しますので必ずしも真値ではありません。電気泳動パターンも泳動条件により変動があることに御留意ください。
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リクエストがあった後、個々のデータの並べ替え等の作業をいたします。作業の都合上、2系統間比較で約一週間ほど回答までに時間がかかります(繁忙時には、もっと時間がかかります。その際にはこちらから連絡いたします)。
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プロジェクト実行者の労力を必要としますので、「とりあえずデータだけ手元においておこう」というような目的でのリクエストは出来るだけ避けてください。
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リクエストの量・内容によっては、対応できない場合があります。リクエストに関する情報は、断りなく報告書・運営委員会議事録等に転記される場合があります。予めご了承ください。
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公開データを使って、研究成果を挙げられたときには、「NBRP・コムギからマーカー情報を得た」旨を論文、報告書などに明記していただくようお願いします。
上記について理解し、 マーカー情報をリクエストする方は次のページに進んでください。
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問合せ先
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担当者:
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那須田 周平
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e-mail:
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