遺伝子 - 詳細

詳細 - 遺伝子

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Basic Information
CGSNL 遺伝子シンボル ATG4
遺伝子シンボルシノニム Atg4, OsAtg4, APG4, Atg4b, OsATG4b
CGSNL 遺伝子名 AUTOPHAGY ASSOCIATED GENE 4
遺伝子名シノニム autophagy 4, AUTOPHAGY RELATED4b, autophagy 4b, AUTOPHAGY ASSOCIATED GENE 4B
タンパク質名
対立遺伝子
染色体番号 4
解説 Q7XPW8, Q2XPP4, DQ269984, ABB77259. PO:0020104; leaf sheath ; PO:0009049; inflorescence ; PO:0009005; root ; PO:0009025; leaf. LOC_Os04g58560. Atg4b in Chung et al. 2009.
形質クラス 生化学的性質
発現
Sequence/Locus
cDNA Accession No. AK069012
MSU ID LOC_Os04g58560.1
LOC_Os04g58560.2
RAP ID Os04g0682000
Links Oryzabase Chromosome View ( IRGSP 1.0 / Build5 )
RAP-DB ( IRGSP 1.0 / Build5 )
Related IDs List ( IRGSP 1.0 / Build5 )
INSD Accession List
(Test version) 		-
マップ
位置情報(cM)
リンケージマップ Classical linkage map
文献
Xia K., Liu T., Ouyang J., Wang R., Fan T., Zhang M.
DNA Res. 2011  18(5)  363-77
Genome-wide identification, classification, and expression analysis of autophagy-associated gene homologues in rice (Oryza sativa L.).
Chung T., Suttangkakul A., Richard D Vierstra
Plant Physiol. 2009  149(1)  220-34
The ATG autophagic conjugation system in maize: ATG transcripts and abundance of the ATG8-lipid adduct are regulated by development and nutrient availability.
Su,W., Ma,H., Liu,C., Wu,J. and Yang,J.
Mol. Biol. Rep. 2006  33(4)  273-278
Identification and characterization of two rice autophagy associated genes, OsAtg8 and OsAtg4.
TextPresso Search Search textpresso for ATG4 ( Recent references may be retrievable, but without any warranty )
DB Reference
Gramene ID GR:0101172
オントロジー
Gene Ontology protein binding( GO:0005515 )
cytoplasm( GO:0005737 )
vacuolar lumen( GO:0005775 )
autophagic vacuole( GO:0005776 )
cysteine-type carboxypeptidase activity( GO:0016807 )
autophagy( GO:0006914 )
APG8-specific protease activity( GO:0019786 )
Trait Ontology -
Plant Ontology root( PO:0009005 )
vascular leaf( PO:0009025 )
inflorescence( PO:0009049 )
leaf sheath( PO:0020104 )
関連系統
-
形質画像
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更新日
2015-07-21 13:38:33.156

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