CLSTF00029     VD

Merge cluster information
Name CLSTF00029
Library ALL 380 cDNA [Download: FASTA]
olea 74 cDNA [Download: FASTA]
olea11f05  olea11h13  olea17b14  olea17c01  olea18o10  olea19p11  olea1i04  olea20m03  olea20p11  olea23g04  olea24d06  olea25f13  olea25n15  olea26j17  olea26n11  olea28f13  olea28n11  olea28o20  olea29c19  olea29o13  olea2o05  olea30e13  olea31i01  olea31n18  olea32b06  olea32c12  olea32n19  olea33i19  olea35b20  olea35c12  olea35e24  olea36k16  olea37j12  olea37l10  olea39l12  olea3a15  olea3h18  olea42f10  olea46e10  olea46j20  olea46k11  olea48j04  olea49c23  olea49n04  olea4g14  olea4h03  olea50m01  olea51b21  olea51d14  olea52l09  olea53h01  olea54d05  olea54e19  olea55a24  olea56c14  olea56i21  olea57a02  olea59c17  olea59f17  olea5a24  olea5o22  olea60k13  olea61d08  olea62a17  olea62a24  olea62f23  olea62j13  olea65b17  olea65l17  olea65n03  olea8i09  olea8l24  olea9a08  olea9j03 
oleb 60 cDNA [Download: FASTA]
oleb11j03  oleb12j17  oleb12o07  oleb14p18  oleb16o08  oleb18b21  oleb18c06  oleb19b02  oleb21c04  oleb24f14  oleb24p08  oleb25e14  oleb26i07  oleb26p13  oleb27c05  oleb27k16  oleb29c11  oleb30m12  oleb31f22  oleb32j19  oleb34a02  oleb34l05  oleb35j01  oleb36a03  oleb36k13  oleb39k10  oleb40f06  oleb40f11  oleb42g19  oleb43d08  oleb43i22  oleb43o06  oleb43o21  oleb44e12  oleb44e16  oleb44k01  oleb45f02  oleb45o20  oleb46h24  oleb47m13  oleb47o04  oleb48e05  oleb48n23  oleb50l01  oleb51b23  oleb51i01  oleb52e22  oleb57e07  oleb59b24  oleb59k10  oleb59o20  oleb59p23  oleb60m20  oleb61d24  oleb62a21  oleb63l10  oleb8m17  oleb9c12  oleb9f13  oleb9p20 
olec 51 cDNA [Download: FASTA]
olec10l03  olec11h10  olec11i08  olec11m09  olec15g03  olec16b21  olec16m15  olec18a03  olec19i17  olec1f07  olec20a23  olec20e16  olec20l24  olec20n06  olec20n20  olec21b06  olec21b10  olec21f21  olec22o16  olec25e06  olec27f16  olec29c18  olec30c20  olec30j22  olec31g07  olec34m12  olec35j19  olec35j22  olec36n20  olec37l20  olec39g09  olec39l13  olec40l23  olec40n10  olec47d20  olec47m21  olec48j04  olec52h15  olec52j23  olec54l15  olec55f13  olec56m06  olec57b17  olec57f12  olec57p19  olec64c01  olec65e15  olec6d14  olec8e09  olec8e17  olec9c10 
olvl 35 cDNA [Download: FASTA]
olvl11g11  olvl12a06  olvl14l11  olvl15k19  olvl15o02  olvl1c16  olvl25i20  olvl25o22  olvl25p21  olvl26o22  olvl27g23  olvl28a20  olvl28b03  olvl31e15  olvl31g01  olvl32l06  olvl32m23  olvl34l24  olvl35c10  olvl37h12  olvl3i19  olvl40m12  olvl42c15  olvl42p07  olvl44j09  olvl46j09  olvl49e01  olvl50p17  olvl55m12  olvl56g05  olvl59h20  olvl5g10  olvl62p16  olvl63e07  olvl6b22 
olli 16 cDNA [Download: FASTA]
olli18l23  olli23a01  olli26g07  olli34g15  olli41c03  olli50p08  olli52o01  olli52o16  olli57h21  olli58b02  olli58i04  olli5l11  olli60p06  olli61j10  olli6o09  olli9j11 
olbr 38 cDNA [Download: FASTA]
olbr12k11  olbr13p09  olbr14a23  olbr19c13  olbr1f04  olbr1p23  olbr22g12  olbr22g15  olbr27g23  olbr29m15  olbr2d16  olbr30n01  olbr34i04  olbr35i24  olbr37l21  olbr38n04  olbr41j17  olbr41l15  olbr43c12  olbr45d06  olbr45o15  olbr49k16  olbr49m11  olbr53n21  olbr55l06  olbr57c01  olbr57l19  olbr58c20  olbr58m06  olbr59f13  olbr5e08  olbr60a09  olbr60g16  olbr60k23  olbr61f07  olbr65j15  olbr6a02  olbr9m18 
olgi 31 cDNA [Download: FASTA]
olgi10d14  olgi10j23  olgi11n18  olgi14a06  olgi16i14  olgi18d17  olgi18m18  olgi1d02  olgi1e08  olgi20o06  olgi22b01  olgi22i24  olgi25o01  olgi27b24  olgi27e12  olgi29j24  olgi2c14  olgi32m12  olgi34c06  olgi34o15  olgi3m22  olgi46e09  olgi53j13  olgi53k22  olgi54m12  olgi58l08  olgi59c02  olgi60p04  olgi64p08  olgi9i04  olgi9j21 
olki 22 cDNA [Download: FASTA]
olki12g10  olki13e21  olki18j11  olki19k20  olki1a22  olki1d08  olki23h17  olki24p17  olki25a04  olki25e14  olki39i10  olki3l17  olki40d13  olki42d15  olki43i03  olki46l11  olki49n11  olki51l10  olki52k05  olki53f14  olki7i12  olki9n24 
olsp 16 cDNA [Download: FASTA]
olsp15h16  olsp18b23  olsp26l03  olsp28n08  olsp2n23  olsp3e08  olsp3m03  olsp3o14  olsp43n11  olsp45d17  olsp59l12  olsp59p07  olsp5m08  olsp63o23  olsp64m11  olsp9k20 
olte 16 cDNA [Download: FASTA]
olte15e24  olte16d01  olte1j02  olte1l17  olte26e22  olte31c07  olte35a17  olte36n21  olte3m12  olte47n19  olte49g10  olte49m10  olte66g06  olte66i11  olte7n20  olte9e08 
olova 21 cDNA [Download: FASTA]
olova15f03  olova16n20  olova18k09  olova23d06  olova24a08  olova24i19  olova28f11  olova30b14  olova38o24  olova39f14  olova40e13  olova40o08  olova4e21  olova51m24  olova53c16  olova58n07  olova58o16  olova59l11  olova65b10  olova7o06  olova9l16 

Before using Assemble Viewer, please ensure that you have the latest version of Java. If you are not using the latest Java version, please download it here. http://java.com/ja/download/


Contig information - 1
Name Contig1
Clone count 1 clones
Length 646
Assemble Result Assemble Viewer
Homology(BLAST)
Top Hit 60S ribosomal protein L13a [Salmo salar]
Score 609
Evalue 4.37917e-91
Detail
Sequence [Download: FASTA]
>Contig1
TTGCTTTTCGCTCATCATGGCGGACCGGTTCAATAAGGTTCTGCTGATAGATGGCAGGGGTCATC
TATTGGGCCGGCTGGCTGCCATTGTGGCTAAACAAGTTCTGCTGGGGCACAAAGTGGTTATAGTG
AGATGTGAAGGCATCAACATTTCTGGCAACTTCTATCGCAACAAGCTGAAGTACCTGGCTTTCCT
GCGCAAGAGGATGAACACCAACCCGTCTCGTGGGCCGTATCATTTCAGAGCTCCCAGCAGGATCT
TTTGGAGGACAGTTAGAGGCATGTTGCCCCACAAAACCAAGAGAGGCCAGGCTGCTCTGGAGAGG
CTGAAGGTGTTTGATGGCATCCCACCTCCCTATGACAAGGTGTGCCACTGTTTGATGACCTATGG
CCAACTGTCTGACTTTTAAATCACATCTTTTGTTAAAAAAAAAGTTTTTAAATAGAAAGCGCGTG
GTTGTGCCAGCTGCTCTTAAAATTGTGCGGCTGAAGCCCTCTCGCAAGTTTGCTCTCCTTGGGCG
TCTCGCCCACGAGGTCGGCTGGAAGTACCAGGCTATCACAGCCACTCTGGAGGAGAAGAGAAAAG
AGAAGGCCAAGCTCCACTATGTCAAGAAAAAGACATTGGTTAAGCTAAGCAAGCTGGCAGA

Contig information - 2
Name Contig2
Clone count 243 clones
Length 729
Assemble Result Assemble Viewer
Homology(BLAST)
Top Hit ribosomal protein L13a [Solea senegalensis]
Score 1009
Evalue 1.01983e-107
Detail
Sequence [Download: FASTA]
>Contig2
GGCCACCCCTGCCTTTTACCATGAGCAACCCCGTTCGTCTTTCTTTTCGCTCATCATGGCGGACC
GGTTCAATAAGGTTCTGCTGATAGATGGCAGGGGTCATCTATTGGGCCGGCTGGCTGCCATTGTG
GCTAAACAAGTTCTGCTGGGGCACAAAGTGGTTATAGTGAGATGTGAAGGCATCAACATTTCTGG
CAACTTCTATCGCAACAAGCTGAAGTACCTGGCTTTCCTGCGCAAGAGGATGAACACCAACCCGT
CTCGTGGGCCGTATCATTTCAGAGCTCCCAGCAGGATCTTTTGGAGGACAGTTAGAGGCATGTTG
CCCCACAAAACCAAGAGAGGCCAGGCTGCTCTGGAGAGGCTGAAGGTGTTTGATGGCATCCCACC
TCCCTATGACAAGAGAAAGCGCGTGGTTGTGCCAGCTGCTCTTAAAATTGTGCGGCTGAAGCCCT
CTCGCAAGTTTGCTCTCCTTGGGCGTCTCGCCCACGAGGTCGGCTGGAAGTACCAGGCTATCACA
GCCACTCTGGAGGAGAAGAGAAAAGAGAAGGCCAAGCTCCACTATGTCAAGAAAAAGACATTGGT
TAAGCTAAGCAAGCTGGCAGAGAAGAACGTGGAGGGCAAGATCGCAAAATACACAGATGTTCTGA
AACAATACGGTGTTCTTGTCTAAAATGGTTTGTTCTGGCGAATAAAGATGAATAAATGTTTATAA
AAAGTGAAAAAAAA
/medaka