Strains

cDNA/BAC/Fosmid

Plasmid for Knock-in Experiments

Information

Medaka Tools

Medaka Strain
in Publications

References
Lectures of
a conference

Related documents

Biological experiments for elementary, junior high and high school students (Japanese)
Medaka experiments that anyone can do (Japanese)
Life of my teacher Tatsuo AIDA (Japanese)

Featured Link

From spawning to hatching of medaka ~nibb×niconico 
A checklist of the parasites of medaka 
medaka SNP(Beta)
Official Endocrine Disruption Website
M-marker 2009
Ensembl Medaka
M-Base
NBRP Medaka Genome Project
MEPD
Genomicus - Synteny browser -
ZFIN
ZIRC
UTGB Medaka
UCSC In-Silico PCR
The Fish Biology Journal of Medaka (Vol.1 - Vol.3)
The Fish Biology Journal of Medaka (Vol.4 - Vol.11)
Introduction to Medaka (NBRP Online Forum 2020)

CLSTF00102     VD

Merge cluster information
Name CLSTF00102
Library ALL 504 cDNA [Download: FASTA]
olea 96 cDNA [Download: FASTA]
olea10c07  olea12h08  olea12m07  olea13f12  olea14b22  olea14c19  olea15g09  olea16p18  olea17l08  olea18c21  olea18i12  olea18k12  olea19g15  olea19m09  olea1c03  olea1d20  olea1m14  olea20j08  olea20n02  olea20p19  olea21j09  olea21j24  olea22d09  olea22f12  olea22l02  olea23f09  olea23k21  olea24f14  olea24j04  olea25e12  olea25f02  olea26b21  olea26k13  olea27a24  olea27h08  olea27l08  olea28a01  olea28a09  olea28f08  olea28o21  olea29k18  olea2f19  olea2g08  olea2n06  olea31m15  olea31n04  olea32c13  olea33b24  olea34d14  olea36e17  olea37d14  olea39f09  olea39k01  olea39n01  olea3a09  olea3f03  olea40b21  olea40j04  olea41m24  olea43e06  olea43e22  olea44m18  olea45h14  olea45l13  olea46k19  olea47p09  olea48a17  olea48b14  olea48d20  olea49b11  olea49i24  olea49o06  olea4a04  olea4c17  olea4d09  olea4o19  olea50d02  olea51e10  olea53i05  olea54b08  olea55e03  olea55j17  olea56e15  olea57a22  olea57d22  olea58d19  olea59d13  olea59k23  olea59m17  olea60i06  olea60i14  olea61p02  olea62j14  olea62o10  olea65k05  olea8f16 
oleb 57 cDNA [Download: FASTA]
oleb11o17  oleb12a04  oleb12o01  oleb13e01  oleb14b23  oleb14c20  oleb14f02  oleb17k08  oleb19c18  oleb19f01  oleb1p18  oleb22b23  oleb23o03  oleb26e07  oleb26g02  oleb26p12  oleb27f02  oleb27f15  oleb2n07  oleb30d18  oleb30n22  oleb32c19  oleb32f10  oleb33h22  oleb34f02  oleb35m12  oleb37d15  oleb38i19  oleb39h16  oleb39m12  oleb3d18  oleb41g06  oleb42h07  oleb45b23  oleb45h02  oleb45j09  oleb45l15  oleb46f18  oleb49l10  oleb52g03  oleb53f20  oleb53o10  oleb54a07  oleb57d13  oleb57i12  oleb59b01  oleb59k16  oleb61b09  oleb61o24  oleb61p22  oleb62p03  oleb63f06  oleb64g07  oleb65k23  oleb7d04  oleb9h04  oleb9m09 
olec 49 cDNA [Download: FASTA]
olec10k11  olec10p18  olec11n22  olec11o04  olec12h06  olec13i13  olec13o18  olec15a11  olec17e08  olec18i21  olec18j12  olec1k02  olec26j22  olec32i08  olec32j23  olec33e01  olec35c03  olec36d04  olec36g05  olec36m01  olec39b09  olec39k12  olec3e03  olec3n20  olec42f07  olec46l10  olec46o23  olec48d07  olec49k13  olec4g01  olec4h23  olec4k03  olec4l03  olec50g05  olec51m19  olec51p05  olec52c20  olec53n24  olec54i16  olec54l13  olec58m23  olec59j07  olec5m14  olec60c04  olec61o12  olec63j09  olec65e22  olec6m03  olec9d09 
olvl 81 cDNA [Download: FASTA]
olvl10c14  olvl11m10  olvl12e05  olvl13c05  olvl13e05  olvl17e11  olvl17n18  olvl18d08  olvl19d02  olvl1j20  olvl20b23  olvl20l24  olvl20n05  olvl21e12  olvl21g01  olvl22c18  olvl23a15  olvl23b24  olvl23c15  olvl24i09  olvl25j03  olvl26d19  olvl26i12  olvl28n06  olvl29n06  olvl30a07  olvl30a22  olvl31g14  olvl33o01  olvl34a17  olvl34g09  olvl34i17  olvl35a17  olvl35i17  olvl35j24  olvl39f21  olvl39l04  olvl3b08  olvl3c22  olvl40i15  olvl40m18  olvl41p12  olvl43p14  olvl46c23  olvl46i24  olvl46j18  olvl48a22  olvl48c01  olvl48c02  olvl48d15  olvl49c01  olvl49n12  olvl4m11  olvl50j15  olvl52e08  olvl52i06  olvl53o11  olvl54e03  olvl55e07  olvl57i10  olvl58d16  olvl59h14  olvl59o03  olvl5i20  olvl5p23  olvl60l11  olvl60m20  olvl61j05  olvl62o17  olvl63d21  olvl63n20  olvl63o17  olvl64m06  olvl64m07  olvl65d24  olvl65j14  olvl65k15  olvl6p14  olvl7h06  olvl7k06  olvl8i04 
olli 24 cDNA [Download: FASTA]
olli13k15  olli17i06  olli18h09  olli18k03  olli19j09  olli20b23  olli25j19  olli26j15  olli27k03  olli37m16  olli39n14  olli3e18  olli40j04  olli41b11  olli44n22  olli47k17  olli4f22  olli53h08  olli54p12  olli55a07  olli56l05  olli63p07  olli8o15  olli9d21 
olbr 32 cDNA [Download: FASTA]
olbr14b20  olbr19g08  olbr23e09  olbr24a10  olbr24c22  olbr27a04  olbr27b15  olbr28h11  olbr28n03  olbr2b06  olbr2e13  olbr34l04  olbr34m14  olbr35g17  olbr36k24  olbr40n05  olbr41a07  olbr41j13  olbr42a01  olbr43p06  olbr4o07  olbr51h15  olbr54f12  olbr55o05  olbr56l01  olbr56o05  olbr57i13  olbr5h19  olbr62a06  olbr63g23  olbr6g06  olbr9g04 
olgi 57 cDNA [Download: FASTA]
olgi16m17  olgi17b22  olgi18h09  olgi18l05  olgi19j08  olgi21d11  olgi21h17  olgi26c15  olgi26g21  olgi26j04  olgi27e13  olgi28k19  olgi29f07  olgi29g12  olgi2i17  olgi30c08  olgi30f07  olgi32p19  olgi34n24  olgi35a11  olgi37k24  olgi37l12  olgi38j13  olgi39o05  olgi3n08  olgi40b06  olgi41j04  olgi42k05  olgi42o15  olgi43l07  olgi44o18  olgi46l12  olgi46m14  olgi48m15  olgi48p05  olgi4n18  olgi52k05  olgi53m03  olgi54h21  olgi55k19  olgi55m13  olgi56e19  olgi56m14  olgi58e07  olgi58f01  olgi59i10  olgi59n21  olgi59p22  olgi5a12  olgi61i17  olgi61m14  olgi64n12  olgi65c22  olgi65e02  olgi65k22  olgi8d05  olgi9l08 
olki 55 cDNA [Download: FASTA]
olki12j21  olki13o12  olki14j05  olki16n18  olki1o04  olki1o22  olki21p04  olki23n07  olki23n15  olki24o21  olki25l02  olki27d14  olki27i11  olki28h23  olki28o09  olki2b02  olki2g23  olki31b11  olki32k07  olki32m09  olki36i04  olki37a09  olki38b22  olki39p10  olki3a21  olki3e01  olki40e10  olki42e22  olki44c17  olki45c09  olki47n10  olki4f03  olki4p12  olki50o19  olki51a06  olki51c22  olki51p07  olki52o06  olki53m02  olki54p09  olki56n23  olki57k03  olki57n09  olki60b23  olki60p22  olki61o06  olki64j23  olki64l09  olki65c07  olki65c13  olki65c22  olki65l06  olki6k19  olki7j09  olki8b02 
olsp 19 cDNA [Download: FASTA]
olsp11l04  olsp17a21  olsp21k09  olsp22n07  olsp23i15  olsp23k01  olsp24b20  olsp27f13  olsp28l17  olsp29h23  olsp41m09  olsp42k24  olsp50e24  olsp53c18  olsp55i20  olsp58i17  olsp59f20  olsp65m17  olsp6d02 
olte 22 cDNA [Download: FASTA]
olte14i18  olte15c11  olte15d06  olte23g22  olte24f17  olte28c06  olte28j24  olte2i10  olte32g12  olte32p09  olte35n08  olte36f11  olte36g19  olte37d14  olte38m24  olte44n08  olte56o16  olte57p19  olte5a17  olte62m22  olte62p23  olte68l10 
olova 12 cDNA [Download: FASTA]
olova10e21  olova14k08  olova15o17  olova20f11  olova22e13  olova40e07  olova45a14  olova54b18  olova61g08  olova61l04  olova6l23  olova7f24 

Before using Assemble Viewer, please ensure that you have the latest version of Java. If you are not using the latest Java version, please download it here. http://java.com/ja/download/


Contig information - 1
Name Contig1
Clone count 1 clones
Length 468
Assemble Result Assemble Viewer
Homology(BLAST)
Top Hit 60S ribosomal protein L36 [Salmo salar]
Score 521
Evalue 1.47875e-51
Detail
Sequence [Download: FASTA]
>Contig1
AGGTAAGCTAATATAACGAGCGCACCGGATCTATTAAAAATCTACGACATCCGCGCGCTCAGCGA
AACTTCTCTCCGAACAAACTGTAGTACCGAACCCACTGCAGCTTCTGTCCCGACATGGCTATCCG
ATATCCCATGGCTGTTGGCCTGAATAAAGGCCACCCAGTCACCAAGAACGTGGCGGCTCCAAAGC
ACAGTCGTCGCCGCGGGCGCCTGACCAAACACACCAAGTTTGTCCGAGACATGATCAGGGAAGTG
TGCGGCTTCGCTCCCTACGAGAGGAGAGCCATGGAGCTGCTGAAGGTGTCCAAGGACAAGAGAGC
GCTGAAGTTCATCAAGAAGAGGATTGGGACCCACATTCGGGCCAAGAGGAAGAGGGAGGAGCTAA
GCAACGTGCTGGCCGCCATGAGGAAGGCAGCCGCCAAGAAAGACTAAATCAATAAATTTTGTTCA
AGTAAAAAAAAAA

Contig information - 2
Name Contig2
Clone count 112 clones
Length 923
Assemble Result Assemble Viewer
Homology(BLAST)
Top Hit 60S ribosomal protein L36 [Salmo salar]
Score 522
Evalue 4.66303e-51
Detail
Sequence [Download: FASTA]
>Contig2
GGCGCACCGGATCTATTAAAAATCTACGACATCCGCGCGCTCAGCGAAACTTCTCTCCGAACAAA
CTGTAGTACCGAACCCACTGCAGCTTCTGTCCCGGTATTTCATCAAAAATCCCAATCGAACCAGA
GAAAATATCACCTCAAACTTGGGTTCCGACATGGCTATCCGATATCCCATGGCTGTTGGCCTGAA
TAAAGGCCACCCAGTCACCAAGAACGTGGCGGCTCCAAAGCACAGTCGTCGCCGCGGGCGCCTGA
CCAAACACACCAAGTTTGTCCGAGACATGATCAGGGAAGTGTGCGGCTTCGCTCCCTACGAGAGG
AGAGCCATGGAGCTGCTGAAGGTGTCCAAGGACAAGAGAGCGCTGAAGTTCATCAAGAAGAGGAT
TGGGACCCACATTCGGGCCAAGAGGAAGAGGGAGGAGCTAAGCAACGTGCTGGCCGCCATGAGGA
AGGCAGCCGCCAAGAAAGACTAAATCAATAAATTTTGTTCAAGTAGAGAGTGGTTTGTCTGTTTT
CTTTGTTTGTGAGAACTTAAGTTACATATGCTCACAGAGCCTCCTATTGGCAATTCCAGCAATTC
AGAATTCTTCAAGAGTTGAAGAATCCAGGCATTGACATCTACAAGTTCTCCATTCCATCTTGTTC
TCAACTGAAACTTTATTTCTACTCTTGGAACAATTTTGTGAGTCGTGAATGATCAATTGGGTCTC
AGTGAGCTGCCGGCTCACATTTCTCCCTCTAGAATGTAAATAGACAGCTGTTGTGTTCACCTCAC
TCAGTTTGCTGTCCTCTCCACCTGAAGCTTTGGCTCTTTGGAATGACGAACATCGATGTACGTTA
TTAAAGCTAAAAACTCTTAAAAACAAATCTGCATGTTTTTGTTAGTATTTTATGATGAACTATTA
AAGCATTTATGTG
/medaka