CLSTF00040     VD

Merge cluster information
Name CLSTF00040
Library ALL 160 cDNA [Download: FASTA]
olea 0 cDNA
oleb 2 cDNA [Download: FASTA]
oleb33g03  oleb36j06 
olec 5 cDNA [Download: FASTA]
olec2l02  olec4f05  olec51p06  olec55n05  olec6o07 
olvl 106 cDNA [Download: FASTA]
olvl11i16  olvl12e17  olvl13n13  olvl14d20  olvl15n04  olvl17o20  olvl18o09  olvl19n13  olvl1d07  olvl1o03  olvl20d11  olvl20k03  olvl20n11  olvl20n16  olvl21b10  olvl21c13  olvl21f18  olvl21h17  olvl21n11  olvl22b16  olvl22c09  olvl22e20  olvl22m15  olvl24n22  olvl25c10  olvl25k06  olvl25m20  olvl26c10  olvl26h09  olvl26k06  olvl26p04  olvl27f08  olvl27i04  olvl27p24  olvl28f13  olvl28g24  olvl28i04  olvl28n19  olvl29o19  olvl2c15  olvl2d21  olvl30c17  olvl31a20  olvl33h04  olvl33k04  olvl33o15  olvl34j20  olvl36d13  olvl37f19  olvl37h23  olvl38i09  olvl39g03  olvl40d12  olvl40e05  olvl40j01  olvl40n15  olvl41a20  olvl41o07  olvl41o14  olvl42l16  olvl43b10  olvl43c04  olvl43d03  olvl43e03  olvl43g20  olvl43o21  olvl44n02  olvl45h14  olvl46g09  olvl47n24  olvl48b21  olvl48j20  olvl48j23  olvl49f24  olvl4a06  olvl4e13  olvl4i23  olvl4m14  olvl53n07  olvl56b07  olvl56c16  olvl57i11  olvl57l21  olvl58e01  olvl59m21  olvl59n13  olvl5a06  olvl5e14  olvl61d19  olvl61g01  olvl61h18  olvl61p17  olvl62d18  olvl63i10  olvl63o07  olvl64d12  olvl64d23  olvl65i19  olvl6a19  olvl6n18  olvl7m11  olvl7p10  olvl8a18  olvl8i20  olvl8o01  olvl8o21 
olli 36 cDNA [Download: FASTA]
olli10f01  olli10i10  olli14j10  olli16m02  olli17l23  olli17p14  olli20k13  olli20l19  olli21e13  olli25p17  olli2a24  olli2b02  olli30l11  olli32o23  olli35k09  olli36o04  olli37g06  olli38f03  olli41l06  olli41m02  olli42m13  olli43g23  olli48e10  olli49l19  olli4g12  olli4i02  olli4k08  olli55l08  olli56m12  olli57b17  olli57j13  olli61b18  olli65g18  olli65h20  olli7n20  olli7o22 
olbr 0 cDNA
olgi 1 cDNA [Download: FASTA]
olgi46f09 
olki 1 cDNA [Download: FASTA]
olki28f02 
olsp 9 cDNA [Download: FASTA]
olsp10k20  olsp11o23  olsp16l10  olsp23e06  olsp2o12  olsp35c24  olsp37j18  olsp40g02  olsp57j05 
olte 0 cDNA
olova 0 cDNA

Before using Assemble Viewer, please ensure that you have the latest version of Java. If you are not using the latest Java version, please download it here. http://java.com/ja/download/


Contig information - 1
Name Contig1
Clone count 2 clones
Length 618
Assemble Result Assemble Viewer
Homology(BLAST)
Top Hit toxin-1 [Oncorhynchus mykiss]
Score 134
Evalue 7.27357e-16
Detail
Sequence [Download: FASTA]
>Contig1
GAGGTTTGGAGTCTCCAAGAGAAATTCTGAAAAATGAAGTTTCATCTACTGCTGGTGCTGCTTCT
GCTGCCGCTCTGCTCAGGTACAAACATCTGCAACTTTGGTAACAAGGTTGGAAAAAACGTTTGGA
CTTTGGAGGCCTTTTTCCCCACAGATTTACAGAGATAACCATTTTCTTTCTGCTGGAAGAAGGTA
GTTATCACACTCACTGACATGCACATACTTGCATTGCAGCGGAGGACTTTTTAATTGAGTGTTAT
GGAGAGGACTACTTCATGGTCAACAACCTGCTGATGCAGTGTAGAGGCAAAGTCCAGCAGGCCTG
CTACACCAGAAGTGAGTCCTCCACAACACATACTAAAGTTTGGAAAAAATAGATCTGTTGCATTG
ACATTTTTCTTTGTGGGGGGGTCTCCAATGTATTCTCCATTTTCAGGTAACGGTGAAAAAGGCTG
CACTCGGTTGGAAAACTGCTCTCGAGCAGGGTGGAGGTGTTGCTACACCGACCGCTGCAACGCCG
GGACATCATAACTGGGAAACTGTAAATGTTCAGAGGGGTTTGGGTTCAAACGTGTGTCAATCCAC
AGAAAATAAAAGTGTTTTTGGGCTGGAAAAAAA

Contig information - 2
Name Contig2
Clone count 43 clones
Length 560
Assemble Result Assemble Viewer
Homology(BLAST)
Top Hit unnamed protein product [Tetraodon nigroviridis]
Score 304
Evalue 3.1208e-26
Detail
Sequence [Download: FASTA]
>Contig2
GGGGGAAAGGGCGTCTAAAGTTTAAACAAACAGGCTTCTCACGGCTGCGTCAGTGGCGATTCGCC
CGTCATGATCGATTGCCGTGCTGGTGCAGAGTATAAAAAGTCAGGTTGGAGGAGCTCATCCGTCA
GGTTTGGAGTCTCCAAGAGAAATTCTGAAAAATGAAGTTTCATCTACTGCTGGTGCTGCTTCTGC
TGCCGCTCTGCTCAGCGGAGGACTTTTTAATTGAGTGTTATGGAGAGGACTACTTCATGGTCAAC
AACCTGCTGATGCAGTGTAGAGGCAAAGTCCAGCAGGCCTGCTACACCAGAAGTAACGGTGAAAA
AGGCTGCACTCGGTTGGAAAACTGCTCTCGAGCAGGGTGGAGGTGTTGCTACACCGACCGCTGCA
ACGCCGGGACATCATAACTGGGAAACTGTAAATGTTCAGAGGGGTTTGGGTTCAAACGTGTGTCA
ATCCACAGAAAATAAAAGTGTTTTTGGGCTGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACNNAANAAAAA
/medaka