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CLSTF00310     VD

Merge cluster information
Name CLSTF00310
Library ALL 488 cDNA [Download: FASTA]
olea 80 cDNA [Download: FASTA]
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Before using Assemble Viewer, please ensure that you have the latest version of Java. If you are not using the latest Java version, please download it here. http://java.com/ja/download/


Contig information - 1
Name Contig1
Clone count 6 clones
Length 820
Assemble Result Assemble Viewer
Homology(BLAST)
Top Hit unnamed protein product [Tetraodon nigroviridis]
Score 556
Evalue 4.36895e-55
Detail
Sequence [Download: FASTA]
>Contig1
AGCCACACATCGACGTTCCCAGGAAGAGTCGCATGAATGTAGGTTACGAAAAGCTTCCTTTGCAA
TTTAAACGGCAGAAATGGCAGATTCAACGAGTTCGCCCGAAGAAGAGACAGAGTTTAGGGAGATG
ATAGCTCGGATCGGTGGTGAAGAGAGAATTTATCTGGTCGGTGAAGCGCGCCAAGGCGAAGCGAC
GGACGGAGATGACACCGGACTGGTCTTTCAGGAGTTCATCCGTGACATGTTTAACAAAAACGTCC
CGGTGCTTAGCAAGAAACAGCCGCCGCGCCCCCATCACGCACATGAGAAGGACTGCAAAGTGGAG
ACCGGTAAAAGTAGTGGAGTGAAGTCCAAGGATGAAGGGTCAAAAGCGCACGAGGAGGAGCGGCC
AACGAGCAAGTCAGCGAGCAGGGCGAACATTTACAGCAAAAAGCGGGCGATAGACTCCCGCATCA
TCGTGTTTATCTTCACGCAGACTTTTATCAGCCACGGCCCGAATGAAGGCTGTTTGATAGAGATC
CTAAAGGACGTAAAGGCGCGCACAAAAGGCGCGTCAATCCCCCGGCCCGCTCTGATTGGATTAGT
CCACACCACGCAGGAGAGCGCAGAGACGCACAGGTGCGCGCAGGTCCTGGAGAGTCTCCTGGGCG
CAGTTTTCCACAAACATCCTTCTGAGGCGGTGTGGGTCGGCTGCTTCCTCCCGAAGACCGAAGCC
AAAATTGTCAGCATCAAGAAAAATGCCTGCAAAGTTGTTTGCGCATCTCAGTCAGCAGATAATAC
CACAGATAAAAGAGACCAGCCTCTGTGTCCGTGCTGGTTC

Contig information - 2
Name Contig2
Clone count 104 clones
Length 889
Assemble Result Assemble Viewer
Homology(BLAST)
Top Hit PREDICTED: similar to ribosomal protein L37 [Monodelphis domestica]
Score 415
Evalue 1.12712e-38
Detail
Sequence [Download: FASTA]
>Contig2
GAGGGGAACATTTTGTGTGTTACACAGGAATCGGAACGGATTTGATGGTGCGCTGCACCTTCTTC
CGGTCTCTTTTCCCACGGCCTCTGGAGGAAAATGACGAAGGGGACATCCTCATTCGGAAAACGCA
GGAACAAGACGCACACTCTGTGCCGTCGTTGTGGAGCCAAAGCTTATCACCTGCAGAAATCAACC
TGCGGGAAGTGTGGTTATCCTCAGAAGCGCAAGAGAAAGTACAACTGGAGCGCCAAGGCCAAGAG
GAGGAACACCACTGGGACTGGCCGCCTGAGGCACCTGAAGGTCGTCTATCGTAGATTCAGGTGAG
GCTGACATGGAAACAAACAAGTAATAAAGCAAAAATCCTAAGGGTGCCAGATTCCCTATTTCTCA
TTTGTGCTTTTTTTGTATTTACATTTTAATTATTGTGTTTGGGTTTATTTTCAAACCAAAAATAT
TGGGAATGTCTGTGATTCTTGACCTTTCAGATGTCTTGAACCTGAAGCTAAAAAATACAATATTT
TAGAAGCTATTTTCCTTCTTATTGTTGAAATAGACAGTCTTTAAATTAAGAATATAGTATTTTTA
AATATGCAGATGTAAATGTACTTAGATATGAATAAAAGATGTGAGTGACATCCAATTAGTCGATG
AATATTTTTTGTGAAGTTAATCTAAATGCATAAAGCATCAAGTTTAGGCTCAAGAAATCATTTTC
TGACAAAAATAGTAAATTGTTTTCCTTTCTAAGAAAAAAACGTTATATCTAAACGGAATGTAATA
TAAGCCAAATTCCTCCGTATCTTTTCTGCTGTTTTTTGTCTGTTTTTGTTTATGATTGTGTAATT
TTTTTNAGAGAAATGTTTTGGTATTCAGGCAGTTATTGATGTTT
/medaka