CLSTF00054     VD

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olova10n01  olova10p13  olova11g01  olova11p06  olova16g06  olova17a04  olova19d08  olova21c18  olova25g08  olova27c08  olova28p23  olova2h15  olova2l15  olova32e10  olova33d16  olova36g19  olova39c14  olova39o07  olova3g06  olova3h14  olova3l23  olova40p08  olova41d16  olova42j24  olova47l14  olova49f09  olova4g01  olova4g12  olova50c12  olova50d07  olova53i24  olova53k07  olova5k06  olova5l02  olova5m20  olova63d05  olova64a10  olova6o19  olova8j01  olova8j18 

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Contig information - 1
Name Contig1
Clone count 1 clones
Length 747
Assemble Result Assemble Viewer
Homology(BLAST)
Top Hit elongation factor 1 alpha [Oryzias latipes]
Score 569
Evalue 2.84632e-105
Detail
Sequence [Download: FASTA]
>Contig1
GCTCTTTCTGTTACCTGGTTAGGGGCAGCAGCTTTGGCCGTGAAAACCCAGAAACACCGAAACAT
TCAAAATGGGAAAGGAAAAAATCCACATTAACATCGTGGTCATTGGCCATGTCGACTCCGGCAAG
TCCACCTCCACCGGTCACCTGATCTACAAGTGCGGAGGAATCGACAAAAGAACCATCGAAAAGTT
CGAGAAGGAAGCCGCTGAGATGGGCAAGGGCTCCTTCAAGTACGCCTGGGTGTTGGACAAACTGA
AGGCTGAGCGTGAGCGTGGTATCACCATCGACATCGCTCTGTGGAAGTTTGAGACCAGCAAGTAC
TATGTGACCATCATTGATGCCCCTGGACACAGAGACTTCATCAAGAACATGATCACTGGAACCTC
CCAGGTAAGGGATTGTAATACTAGTTTTACTTTTTCTGCCCCAAAAAAATCACATTTAACCTTTG
GCTGTTTGTGTTTTCATCCAGGCTGACTGCGCTGTGCTGATTGTCGCTGCTGGCGTTGGTGAGTT
TGAGGCTGGTATCTCAAAGAACGGGCAGACCCGTGAGCACGCCCTGCTGGCCTTCACCCTTGGAG
TGAAGCAGCTCATCGTTGGCGTCAACAAGATGGACTCCACCGAGCCCCCTTACAGCCAGGCCCGT
TTTGAGGAAATCCAAAAGGAAGTAAGCACCTACATCAAGAAGATCGGCTACAACCCAGCTGCAGT
GGCTTTTGTCCCCATCTCTGGATGGCATGGAG

Contig information - 2
Name Contig2
Clone count 56 clones
Length 885
Assemble Result Assemble Viewer
Homology(BLAST)
Top Hit elongation factor 1 alpha isoform 2 [Solea senegalensis]
Score 1288
Evalue 6.55249e-140
Detail
Sequence [Download: FASTA]
>Contig2
GAGACACCGTGCAGCCCTCCCCCATCTCCAGTATAAAAAAACCCCACATGTCCAGATCTGTCCTT
TTTTGCCTCTGTTAAAATCAGGGACCCCTTGATTGTCGCTGGACTTAAGCCGGAAAGTCAAAATG
GGAAAGGAAAAAATCCACATTAACATCGTGGTCATTGGCCATGTGGATTCCGGCAAGTCCACAAC
TACCGGCCACCTGATCTACAAGTGCGGAGGAATCGACAAGAGAACCATCGAGAAGTTTGAGAAGG
AAGCTGCTGAGATGGGTAAGGGCTCCTTCAAGTACGCCTGGGTGTTGGACAAACTGAAGGCTGAG
CGTGAGCGTGGTATCACCATCGACATCGCTCTGTGGAAGTTTGAGACCAGCAAGTACTATGTGAC
CATCATTGATGCCCCTGGACACAGAGACTTCATCAAGAACATGATCACTGGAACCTCCCAGGCTG
ACTGTGCTGTGCTGATCGTCGCTGCTGGCGTTGGTGAGTTTGAGGCTGGTATCTCCAAGAACGGG
CAGACCCGTGAGCACGCCCTGCTGGCCTTCACCCTTGGAGTGAAGCAGCTCATCGTTGGCGTCAA
CAAGATGGACTCCACTGAGCCCCCTTACAGCCAGGCCCGTTTTGAGGAAATCCAAAAGGAAGTGA
GCGCCTACATCAAGAAGATCGGCTACAACCCAGCCACCGTGGCTTTTGTCCCCATCTCTGGATGG
CACGGAGACAACATGCTGGAGGCCAGCGACAAGATGAGCTGGTTCAAGGGCTGGAAGATTGAGCG
TAAGGAGGGAGGAGCAACAGGTGTTACACTCCTGGAGGCTTTGGACTCCATTCTGCCGCCCAGTC
GCCCCACTGACAAACCCCTGCGTCTGCCCCTGCAGGACGT

Contig information - 3
Name Contig3
Clone count 408 clones
Length 1174
Assemble Result Assemble Viewer
Homology(BLAST)
Top Hit RecName: Full=Elongation factor 1-alpha; Short=EF-1-alpha
Score 840
Evalue 9.04617e-88
Detail
Sequence [Download: FASTA]
>Contig3
GCGGCCGCGTGCTGACGTTTTTTTTCGCAGGAAAGTGTGTGATTTGCGGGGTTTGCACCGAGGAG
GGGGCCGGATATTCAGGCCGCCTCCCAGTCCGTATAAAAGCTCCCAATCCTCCTCCAGTCTTCCT
CTTTCTGTTACCTGGTTAGGGGCAGCAGCTTTGGCCGTGAAAACCCAGAAACACCGAACAGAAAC
ATTCAAAATGGGAAAGGAAAAAATCCACATTAACATCGTGGTCATTGGCCATGTCGACTCCGGCA
AGTCCACCTCCACCGGTCACCTGATCTACAAGTGCGGAGGAATCGACAAAAGAACCATCGAAAAG
TTCGAGAAGGAAGCCGCTGAGATGGGCAAGGGCTCCTTCAAGTACGCCTGGGTGTTGGACAAACT
GAAGGCTGAGCGTGAGCGTGGTATCACCATCGACATCGCTCTGTGGAAGTTTGAGACCAGCAAGT
ACTATGTGACCATCATTGATGCCCCTGGGACACAGAGACTTCATCAAGAACATGATCACTGGAAC
CTCCCAGGCTGACTGCGCTGTGCTGATTGTCCGCTGCTGGCGTTGGTGAGTTTGAGGCTGGTATC
TCAAAGAACGGGCAGACCCGTGAGCACGCCCTGCTGGCCTTCACCCTTGGAGTGAAGCAGCTCAT
CGTTGGCGTCAACAAGATGGACTCCACCGAGCCCCCCTTACAGCCAGGGCCCGTTTTGAGGAAAT
CCAAAAGGAAGTAAGCACCTACATCAAGAAGATCGGCTACAACCCCAGCTGCAGTGGCTTTTTGT
CCCCATCTCTGGATGGCATGGAGACAACATGCTGGAGGCCAGCGACAAGATGAGCTGGTTCAAGG
GCTGGAAAGATTGAGCGCAAGGACGGAAAATGCCAGTGGAAACAACACTCCTTGAAAGCTCTTGA
TGCCCATCCTGCCCACCTTTCTCGCCCCACCGACAAAACCCCTGCGTCTGCCCCCTGCAGGACGT
CTACAAAATCGGCGGTATTGGAACTGTCCCTGTCGGCCGTGTTGAGACTGGAGTCCTGAAGCCAG
GCATGGTTGTCACCTTTGCTCCCCCCAACCTGACCACTGAGGTCAAGTCAGTGGAGATGCACCAC
GAGTCTTTACCAGAAGCTGTGCCCGGTGACAACGTTGGCTTCAACATCAAGAACGTGTCCGTCAA
GGAA
/medaka