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CLSTF00315     VD

Merge cluster information
Name CLSTF00315
Library ALL 418 cDNA [Download: FASTA]
olea 82 cDNA [Download: FASTA]
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olte 30 cDNA [Download: FASTA]
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Before using Assemble Viewer, please ensure that you have the latest version of Java. If you are not using the latest Java version, please download it here. http://java.com/ja/download/


Contig information - 1
Name Contig1
Clone count 4 clones
Length 783
Assemble Result Assemble Viewer
Homology(BLAST)
Top Hit RecName: Full=40S ribosomal protein S16
Score 262
Evalue 4.88631e-21
Detail
Sequence [Download: FASTA]
>Contig1
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TAAATATGCTCTTATAGTGTTTCTTAACTTTAAATTTTTGTTTTCTGTGTATTTCAGAAACATGC
CAGCTAAAGGTCCTCTGCAGTCTGTCCAGGTGTTTGGACGTAAAAAGACGGCCACAGCAGTTGCC
CACTGCAAGAGGGGCAATGGCCTGATCAAGGTGAACGGCAGACCCCTGGAGATGGTGGAGCCTTC
TACACTTCAGTACAAGGTTCTTATCTTGATTCCTTGAATTTTAGTGAAGTAGAAGGTGCGATGCC
TTTATTTTGAAGTAACACTTAGGGACGTTGACGCTCTTTTAACGTCTAATCTACGTTGTAACTGC
TAAATATGACCCAAAACGGTATTGTATGACATGATCGTAAAGGTTTTCCCATCATCTGTGTGATT
AACCTCAAAAGTTTGTGTGTATTAACAAGTTATAGTAGTTTTAATGTTTTCTATCCCTTCAAACT
AAGATAAAGTTTATCTTTCTAGTATTTTGTTTTGTTTGTTACTTTACAAGAATTTGCCTATAAAT
TGAGCAAATCCATTAACAAACTAGCTGTTGTGATCAGCTTCTGGAGCCAGTTCTGTTGTTGGGAA
AGGAGCGTTTTGCTGGAGTTGACATCAGAGTCCGAGTGAAGGGGGGTGGACATGTCGCACAAGTC
TATGCCATCCGTCAGGCCATCTCTAAGGCTCTGGTTGCATACTACCAGAAGTATGTTGATGAAGC
CTC

Contig information - 2
Name Contig2
Clone count 147 clones
Length 855
Assemble Result Assemble Viewer
Homology(BLAST)
Top Hit PREDICTED: similar to 40S ribosomal protein S16 [Canis familiaris]
Score 628
Evalue 3.21093e-68
Detail
Sequence [Download: FASTA]
>Contig2
TCGCTCTTCCTGCGGCATCCTAGTTGAAGGCGGTGTGTTTCGGAGACAGATCCCGACAAAATCAC
ATTAAATATGCTCTTATAGTGTTTCTTAACTTTAAATTTTTGTTTTCTGTGTATTTCAGAAACAT
GCCAGCTAAAGGTCCTCTGCAGTCTGTCCAGGTGTTTGGACGTAAAAAGACGGCCACAGCAGGTT
GCCCACTGCAAGAGGGGCAATGGCCTGATCAAGGTGAACGGCAGACCCCTGGAGATGGTGGAGCC
TTCTACACTTCAGTACAAGCTTCTGGAGCCAGTTCTGTTGTTGGGAAAGGAGCGTTTTGCTGGAG
TTGACATCAGAGTCCGAGTGAAGGGGGGTGGACATGTCGCACAAGTCTATGCCATCCGTCAGGCC
ATCTCTAAGGCTCTGGTTGCATACTACCAGAAGTATGTTGATGAAGCCTCCAAGAAGGAGATCAA
AGACATCCTGATCCAGTACGACCGGACCCTGCTGGTCGCTGATCCACGTCGCTGCGAGTCCAAGA
AGTTCGGTGGACCTGGAGCTCGTGCCCGCTACCAGAAGTCCTACCGTTAATCGCTGTGTACATTT
ATGCAATAAACTGGATGAAAGAAGGATGTTGCTGTTGGAGTTTTGACTTTTAAAAAATGTTTTTA
CTATTCATCCCACGATCCTTCAAACGTAGATGTAGCTGTTAACCTGCCATGAACCTAAAAGCAAA
GTCTTTTTAAAAGCTAAATTTTTGCTCTTTAATTTTATTTTCTTTGTGAATTTATTTCTTAAAAG
ATGATTTTAAACATTTTAAATAAAACTGCATGAATACTTTTGCTATTATTTAAGGATTTTCCTGG
ATTGACAAAG
/medaka