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cDNA/BAC/Fosmid

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Medaka full length cDNA  VD

ライブラリ名 組織名 発生段階 Entries クラスター
5' 3' Total 5' 3' Total
olea   胚   ST22   22258 22215 44473 6077 5554 11631
oleb   胚   ST35   23134 23127 46261 7426 6876 14302
olec   稚魚   ST40   23000 23138 46138 6532 6211 12743
olvl   雄肝臓   成魚雄   18867 18978 37845 2497 2376 4873
olli   雌肝臓   成魚雌   23315 23534 46849 2678 2558 5236
olbr   脳   成魚雌雄   22582 22442 45024 7763 6984 14747
olgi   鰓   成魚雌雄   22803 22826 45629 6793 6323 13116
olki   腎臓   成魚雌雄   23150 22979 46129 6305 5934 12239
olsp   脾臓   成魚雌雄   23402 23433 46835 5060 4792 9852
olte   精巣   成魚雄   24301 24342 48643 7078 6852 13930
olova   卵巣   成魚雌   22934 23184 46118 5686 5521 11207
merge 249746 250198 499944 26314 21588 47902
Non redundant full length cDNA sequences
olvl, olea, oleb, olec, olbr, olova, olte 15381 15381

Medaka cDNA for MF01

ライブラリ名 組織名 発生段階 Entries クラスター
5' 3' Total 5' 3' Total
MF01ALA   肝臓ライブラリー   Male and female adult liver mRNA   12258 12716 24974 2360 2050 4410
MF01ASD   雌個体ライブラリー   Adult female whole body mRNA   13456 14048 27504 3390 3353 6743
MF01FFA   稚魚 full-length ライブラリー   Stage 40 whole embryoes mRNA   11242 11658 22900 2623 2507 5130
MF01FSA   稚魚ライブラリー   Stage 40 whole embryoes mRNA   15602 15990 31592 5508 5179 10687
MF01SSA   胚ライブラリー   Stage 23 whole embryoes mRNA   14530 14167 28697 5495 4846 10341
MF01SSB   胚ライブラリー   Stage 23 whole embryoes mRNA   12534 12662 25196 4897 4480 9377
MF015DA   胚ライブラリー   Stage 35 whole embryoes mRNA   11886 11811 23697 5562 5046 10608

Full sequence for MF01FFA and MF015DA

ライブラリ名 Entries
MF01FFA 291
MF015DA 454

Medaka cDNA for HNI    

ライブラリ名 組織名 Entries
OLa 雌雄成魚全身 1669
OLb 培養細胞 2209
OLc 培養細胞 20J/m2 UV ± PR 2303
OLd 卵巣 3479
OLe 雌雄肝臓 1272
OLf 培養細胞　gamma-irradiation 1664

長濱研ＥＳＴ解析クローン    

ライブラリ名 組織名 Entries
OLA03 7日胚 4915
OLA04 孵化直後の稚魚 3045
OLA05 成魚卵巣 2400
OLA06 孵化後5日の稚魚 2739
OLA07 孵化後10日の稚魚 1666
OLA08 孵化後15日の稚魚 1570

Medaka BAC clone

ライブラリ名 種名・系統 Entries
5' 3' Total
ola1   O. latipes·Hd-rR   55077 54940 110017

Medaka Fosmid clone

ライブラリ名 種名・系統 Entries
5' 3' Total
golwf 2004   O. latipes·Hd-rR   47018 59145 106163
golwf 2005   O. latipes·Hd-rR   178175 168774 346949

Related species BAC clone

ライブラリ名 種名・系統 Entries
Total
IMBX   Oryzias dancena (XX individual)   36864
IMBY   Oryzias dancena (YY individual)   36864
LMB1   Oryzias luzonensis (XX individual)   50688
OCB   Oryzias celebensis (XY individual)   26112
OHB1   Oryzias hubbsi (ZZ individual)   40704
OJV1   Oryzias javanicus (ZZ individual)   50688

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Clone 項目別検索
Resource Type
Accession no  (ex. DK230587)
Clone name  (ex. olvl10a01)
Direction 5'  3'
Homologous gene
OR  AND 		 (ex. ribosomal protein)
/medaka