BLASTN 2.2.8 [Jan-05-2004]
Reference:
Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schäffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= AE000318|10863
(10,863 letters)
Database: NAE000318.fasta
1 sequences; 10,863 total letters
Searching.done
Score E
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NAE000318|10863|same 2.153e+04 0.0
>NAE000318|10863|same
Length = 10863
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Strand = Plus / Plus
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Strand = Plus / Minus
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Query: 4752 ctgttgcaggaa 4763
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Sbjct: 229 ctgttgcaggaa 218
Database: NAE000318.fasta
Posted date: May 26, 2005 3:22 PM
Number of letters in database: 10,863
Number of sequences in database: 1
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
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Number of successful extensions: 14
Number of sequences better than 10.0: 1
Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 1
Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 0
Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 0
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length of query: 10,863
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effective search space used: 117700801
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