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株番号 NIES-3808
保存機関名 国立環境研究所
門名 Dinophyta 綱名 Dinophyceae
目名 科名
学名   Breviolum minutum T.C.LaJeunesse, J.E.Parkinson & J.D.Reimer
シノニム Symbiodinium minutum LaJeunesse, J.E.Parkinson & J.D.Reimer; Zooxanthella minuta (LaJeunesse, J.E.Parkinson & J.D.Reimer) Guiry & R.A.Andersen 2018
一般名 渦鞭毛藻; 褐虫藻
地名(採集年月) 米国  フロリダ  Tennessee Reef(水深-22m), Florida Keys (2002-10-20)
採集者名  
生息環境(分離源) 海域
生息環境の詳細 水深(-22m); 貧栄養  サンゴ礁
分離者名(分離年月) Coffroth, M. A.
同定者名 Coffroth, M. A.
株の状態 非無菌; 単藻; クローン
保存形態 凍結保存
凍結保存 不明
培養条件(前培養条件) 培地名:f/2
培地形状:
温度:20 ℃
光強度:3 μmol phtons/m2/sec  明暗周期:10L:14D
継代培養周期:30 D
遺伝子情報 BAC paired-end sequences (GA393224-GA453876 ) CO1 (LC002801 ) CO3 (LC002802 ) Fosmid paired-end sequences (GA453877-GA605429 ) Plastid minicircle sequences (JX094304-JX094335 ) Whole-genome (BASF00000000 )
画像
特性
  共生(サンゴ)  ゲノム解読株 (Shoguchi et al. 2013); Clade B
細胞サイズ(min-max)   体制 単細胞性  
注意事項 凍結保存[2023 Nov]  

文献
Shoguchi, E., Shinzato, C., Hisata, K., Satoh, N., Mungpakdee, S.: 2015: The large mitochondrial genome of Symbiodinium minutum reveals conserved noncoding sequences between dinoflagellates and Apicomplexans.: Genome Biol. Evol., 7, 2237-2244.
Strains: 3808

Mungpakdee, S., Shinzato, C., Takeuchi, T., Kawashima, T., Koyanagi, R., Hisata, K., Tanaka, M., Goto, H., Fujie, M., Lin, S., Satoh, N., Shoguchi, E.: 2014: Massive gene transfer and extensive RNA editing of a symbiotic dinoflagellate plastid genome.: Genome Biol. Evol., 6, 1408-1422.
Strains: 3808

Shoguchi, E., Shinzato, C., Kawashima, T., Gyoja, F., Mungpakdee, S., Koyanagi, R., Takeuchi, T., Hisata, K., Tanaka, M., Fujiwara, M., Hamada, M., Seidi, A., Fujie, M., Usami, T., Goto, H., Yamasaki, S., Arakaki, N., Suzuki, Y., Sugano, S., Toyoda, A., Kuroki, Y., Fujiyama, A., Medina, M., Coffroth, M. A., Bhattacharya, D., Satoh, N.: 2013: Draft assembly of the Symbiodinium minutum nuclear genome reveals dinoflagellate gene structure.: Curr. Biol., 23, 1399–1408.
Strains: 3808

Jiang, J., Lu, Y.: 2019: Metabolite profiling of Breviolum minutum in response to acidification.: Aquat. Toxicol., 213, 105215 (article ID).
Strains: 3808

Zhou, W., Zhang, X., Wan, A., Yang, L., Gan, Q., Yi, L., Summons, R. E., Volkman, J. K., Lu, Y.: 2022: Widespread sterol methyltransferase participates in the biosynthesis of both C4α- and C4β-methyl sterols.: J. Am. Chem. Soc., 144, 9023-9032.
Strains: 3808